1. Mouhamadou Ba. Composition guidée de services : application aux workflows d'analyse de données en bio-informatique. PhD thesis, Thèse de l'INSA Rennes - École doctorale MATISSE, 4 décembre 2015. Note: Supervisée par M. Ducassé et S. Ferré. [Abstract] [bibtex-entry]

1. Sébastien Ferré and Peggy Cellier. Graph-FCA: An extension of formal concept analysis to knowledge graphs. Discrete Applied Mathematics, 273(5):81-102, 2020. [WWW] [doi:https://doi.org/10.1016/j.dam.2019.03.003] Keyword(s): Formal concept analysis, Knowledge graph, Semantic web, Graph homomorphism. [Abstract] [bibtex-entry]



2. Mouhamadou Ba, Sébastien Ferré, and Mireille Ducassé. Solving Data Mismatches in Bioinformatics Workflows by Generating Data Converters. Transactions on Large-Scale Data and Knowledge-Centered Systems (TLDKS), LNCS 9510:88-115, 2016. Keyword(s): workflow, data conversion, bioinformatics, type system. [Abstract] [bibtex-entry]

1. Sébastien Ferré and Peggy Cellier. Graph-FCA in Practice. In O. Haemmerlé, G. Stapleton, and C. Faron-Zucker, editors, Int. Conf. Conceptual Structures (ICCS) - Graph-Based Representation and Reasoning, LNCS 9717, pages 107-121, 2016. Springer. [WWW] [doi:10.1007/978-3-319-40985-6_9] Keyword(s): formal concept analysis, knowledge graph, graph pattern, algorithm. [Abstract] [bibtex-entry]



2. Mouhamadou Ba, Sébastien Ferré, and Mireille Ducassé. Safe Suggestions Based on Type Convertibility to Guide Workflow Composition. In F. Esposito, O. Pivert, M.-S. Hacid, Z.W. Ras, and S. Ferilli, editors, Int. Symp. Foundations of Intelligent Systems (ISMIS), LNCS 9384, 2015. Springer. [Abstract] [bibtex-entry]



3. Mouhamadou Ba, Sébastien Ferré, and Mireille Ducassé. Generating Data Converters to Help Compose Services in Bioinformatics Workflows. In Hendrick Decker et al., editor, Int. Conf. Database and Expert Systems Applications (DEXA), LNCS 8644, pages 284-298, 2014. Springer. Keyword(s): workflow, bioinformatic, data converter, convertibility, rule system. [Abstract] [bibtex-entry]



4. Mouhamadou Ba. Guided Composition of Tasks with Logical Information Systems - Application to Data Analysis Workflows in Bioinformatics. In P. Cimiano, O. Corcho, V. Presutti, L. Hollink, and S. Rudolph, editors, Extended Semantic Web Conf., LNCS 7882, pages 661-665, 2013. Springer. [bibtex-entry]

1. Annie Foret. Logical Information Systems for Linguistic Data: TermLis, 2017. [WWW] [PDF] [Abstract] [bibtex-entry]

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